全血基因组DNA小量提取试剂盒
Total Blood DNA Miniprep
Kit
● 试剂盒内容及保存:
试剂盒组成
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RTG2406
(50次)
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贮存方式
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缓冲液DL1
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16
ml
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常温
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缓冲液DL2
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16
ml
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常温
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去蛋白液GD(浓缩液)
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18 ml
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常温
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漂洗液PW(浓缩液)
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25
ml
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常温
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洗脱缓冲液EB
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15
ml
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常温
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吸附柱CG
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50个
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常温
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收集管(2
ml)
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50个
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常温
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说明书
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1份
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● 储存条件和效期:
该试剂盒常温贮存,常温运输。开封后有效期一年。
● 产品简介:
全血基因组DNA
小量提取试剂盒可从200-400 μl体积新鲜、冷冻或抗凝全血样本中快速分离纯化基因组DNA。该试剂盒可以在30分钟内完成单个或多个样品的操作。 提取过程无需使用蛋白酶K消化,不需要酚氯仿抽提,
也无需耗时的异丙醇沉淀等过程 。
使用该试剂盒提取到的DNA
可以用于PCR,Southern杂交,酶切消化等实验。
● 准备工作:
1. 准备无水乙醇;1.5
ml离心管;离心机
2. 按照标签所示在去蛋白液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇,混匀后盖紧瓶盖后常温贮存备用。
3. 每次使用前请检查缓冲液DL1和DL2是否有沉淀生成,如果出现沉淀,37℃温浴至沉淀溶解后再使用。
● 标准操作步骤:
如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在常温下离心。
注意:以下方案适用于400
μl体积新鲜或冷冻血液样本。如果使用低于400 μl的全血样本,必须按比例减少缓冲液DL1和DL2的用量或者用1×PBS溶液补齐至400 μl,严格按照缓冲液DL1:全血:缓冲液DL2=3:4:3体积比进行操作,否则将导致后续操作无法进行。
1. 加入300μl缓冲液DL1于1.5
ml离心管中。
2. 加入400
μl抗凝全血,漩涡剧烈震荡30秒。 注:如果低于400 μl血液,用1×PBS补齐到400
μl。
3. 加入300μl缓冲液DL2,剧烈摇动离心管3-5次,漩涡剧烈震荡30秒-60秒。
注:加入缓冲液DL2后,会出现大量血红蛋白沉淀,必须剧烈震荡。
4. 12000 rpm 离心2分钟。
5. 把吸附柱装在2ml收集管中,将第4步得到的上清溶液(一般可吸取650-700 μl)全部转入吸附柱中(小心别触及沉淀),12000 rpm离心2
min,倒弃流出液重新套上收集管。
注:吸附柱的最大体积为850 μl,如上清超过此体积,可分2次离心,保证所有上清都加到柱中。
6.加入500 μl
去蛋白液GB(注意是否已经加入乙醇)至柱子中,12000 rpm离心1min,弃流出液。
7. 将吸附柱重新套回2
ml收集管中,加入700μl 漂洗液PW(注意是否已经加入乙醇)至柱子中,12000 rpm离心1min,倒弃流出液;
8. 再加入500 μl
漂洗液PW(注意是否已经加入乙醇)至吸附柱中,12000
rpm离心1min, 弃流出液。
注:吸附柱膜上如有血色素残余,这是正常现象,不会影响DNA的洗脱和纯度。
9. 将吸附柱重新套回2
ml收集管中,12000 rpm空甩离心2 min以干燥柱子的基质;
注:这一步骤至关重要,不要省略,否则残余乙醇会影响后续酶切或PCR实验。
10. 将柱子置于1.5ml灭菌离心管,向吸附柱O型垫圈中央悬空加入50-100 μl65℃预热的洗脱缓冲液EB或灭菌去离子水,盖好吸附柱管盖,常温静置2 min;
注: = 1 \* GB3 ① 洗脱缓冲液体积最好不少于50 μl,体积过小影响回收效率。
=
2 \* GB3 ② 洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。
11. 12000 rpm离心
2 min洗脱DNA。保留含DNA的流出液。将DNA储于-20℃。
● DNA浓度及纯度检测:
基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。提取的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。可配制0.8-1.0%琼脂糖凝胶,使用λ/HindIII判断基因组的大小,完整的基因组大小应在23kb以上。使用分光光度计检测时, OD260/OD280比值应为1.7–1.9之间,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水洗脱,比值可能偏低,但并不表明DNA纯度不高。
● 常见问题分析:
常见问题
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可能原因
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建议
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堵柱子
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样本体积不对,裂解不完全
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未按照说明书使用指定体积操作,请严格按照缓冲液DL1:全血:缓冲液DL2=3:4:3体积比进行操作
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回收不到DNA或得率低
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堵柱子
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见上
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化疗病人全血中提取DNA
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化疗病人血液中白细胞数量减少,导致DNA数量降低
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全血样品保存不当,导致全血溶血导致DNA降解
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4℃冰箱中贮存2周的全血开始出现溶血现象,此时DNA随贮存时间延长会程序分解,最终导致分离不到电泳可见的DNA;全血应该-20℃或-80℃贮存。
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去蛋白液GD和漂洗液PW没有按说明书加入乙醇稀释
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使用前按说明书加入适量的无水乙醇进行稀释
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DNA纯度差
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高A260/A280比率大于1.8
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考虑全血样品的新鲜程度。陈旧全血中的DNA会降解成小片段DNA或核苷酸混合物,导致A260读数变大
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DNA中有RNA污染
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使用非常新鲜的全血提取DNA时电泳结果会有RNA污染,RNA不能作为扩增模板,不会影响PCR扩增。如要去除RNA,可在步骤1加入缓冲液DL1时同步加入5 μl RNaseA溶液(10mg/ml)
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洗涤时柱中有带颜色的遗留物
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未按照说明书使用指定体积操作
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请严格按照缓冲液DL1:全血:缓冲液DL2=3:4:3体积比进行操作
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去蛋白液GB和漂洗液PW没有按说明书加入乙醇稀释
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使用前按标签加入标示体积的无水乙醇进行稀释
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实验示例:
400μl human blood gDNA 上样5μl
人血液基因组扩增人β-球蛋白 1.3kb 片段