RealPure
Plant RNA Extraction Kit
(for
containing high polysaccharide and polyphenol components)
RealPure多糖多酚植物RNA提取试剂盒
● 试剂盒内容及保存:
试剂盒组成
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RTR2304-S
(5次)
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RTR2304-01
(50次)
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贮存方式
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裂解液RL
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5
ml
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30
ml
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常温
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缓冲液PRS
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0.5
ml
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3
ml
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常温
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裂解液RL
plus
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3
ml
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30
ml
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常温
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去蛋白液RD
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3
ml
|
30
ml
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常温
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漂洗液RW(浓缩液)
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1.5
ml
首次使用按照标签加入无水乙醇
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25
ml
首次使用按照标签加入无水乙醇
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常温
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RNase-free水
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1
ml
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5
ml
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4℃
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DNA清除柱CS(RNase-free)
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5个
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50个
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常温
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RNA吸附柱CR(RNase-free)
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5个
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50个
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常温
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收集管
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10个
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100个
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常温
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2
ml离心管(RNase-free)
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5个
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50个
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常温
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1.5
ml离心管(RNase-free)
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15个
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150个
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常温
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说明书
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1份
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1份
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● 储存条件和效期:
RNase-free水4℃保存;其他试剂在常温(25℃左右)干燥条件下,可保存1年。试剂盒常温运输。
● 产品简介:
本试剂盒可从植物叶片、茎、幼苗、果肉中快速提取总RNA,可同时处理大量不同样品。试剂盒配套缓冲液PRS(Phenolic Remove Solution)可以去除植物中的多糖多酚对RNA提取的影响。20-30分钟内即可完成反应,提取的总RNA纯度高,没有DNA和蛋白的污染,可用于Northern
blot、Dot blot、polyA
筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等实验。
该试剂盒不能有效提取植物种子、块茎、鳞茎的RNA,提取这些材料的RNA请选择RealPure植物种子RNA提取试剂盒(Cat:RTR2308)。
● 准备工作:
1操作前在裂解液RL中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如500
μl RL中加入5 μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的
RL4 ℃可放置3天。
2
按照标签所示在漂洗液RW中加入无水乙醇(自备),混匀后盖紧瓶盖后室温贮存备用。
3
所有离心步骤均在常温下进行。
● 操作步骤:
1. 样品处理:
1.1 1.5 ml离心管中加入500 μl裂解液RL(使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇),50
μl缓冲液PRS混匀备用。
注:多糖多酚植物(如银杏,毛白杨等)加入RL后,要加入缓冲液PRS,普通植物(如拟南芥,小麦,水稻,烟草)可以不加缓冲液PRS。如果不能判断植物是否为多糖多酚植物,请加入缓冲液PRS。
注:快速判断是否为多糖多酚植物:
取20mg左右的植物材料,放入1.5
ml离心管中,加入0.5 ml 0.2 M NaOH溶液,95℃
10分钟,观察裂解物颜色。颜色为绿色或淡黄色为普通植物;颜色为棕黄色或棕红色为多糖多酚植物。
1.2将植物材料加入到液氮预冷的研钵中,用研杵研磨,其间不断加入液氮,直至研磨成粉末状。取50 mg粉末迅速加入到离心管中,涡旋剧烈震荡混匀,常温放置5分钟。
注:一定不要加入超过50 mg的粉末,否则样品超过裂解液RL的裂解能力会导致RNA提取失败。
2. 离心取上清:
13,000 rpm离心5
min,小心吸取收集管中的上清至1.5 ml RNase-free的离心管中,吸头尽量避免接触收集管中的细胞碎片沉淀。一般可获得400 μl上清。
3. 去除基因组污染:
上清中加入0.5倍体积的无水乙醇(如400 μl上清中加入200 μl无水乙醇),混匀(此时可能会出现沉淀),得到的溶液和沉淀一起转入DNA清除柱CS(清除柱放入收集管中)中,13,000 rpm离心2分钟,弃掉收集管中的废液。
注:确保全部溶液都收集到收集管中,如果膜上有残留液体,延长离心时间至5分钟,保证膜上无残留液体。
4. 洗脱RNA:
将DNA清除柱放入一干净的2 ml离心管中,在清除柱中加入500 μl 裂解液RL
plus,13,000 rpm离心1分钟,收集滤液(注意:RNA在滤液中,不要丢弃),滤液中加入250 μl无水乙醇,此时可能会出现沉淀,立即混匀,不要离心。
5. RNA挂柱:
将全部溶液加入到RNA吸附柱CR中(吸附柱放入收集管中),13,000 rpm离心2分钟。
注:确保溶液全部过滤到收集管中,膜上无残留,如有必要,可以延长离心时间至5分钟。
6. 去除RNA中的蛋白污染:
向RNA吸附柱CR中(吸附柱放入收集管中)加入500 μl 去蛋白液RD,13,000
rpm离心1分钟,弃废液。
7. 去除RNA中的其他杂质:
向RNA吸附柱CR中加入700
μl漂洗液RW(使用前请先检查是否已加入乙醇), 13,000 rpm离心1分钟,弃废液。
8. 进一步去除RNA中的其他杂质:
向吸附柱CR中加入500
μl漂洗液RW (使用前请先检查是否已加入乙醇),13,000 rpm离心1
分钟,弃废液,将吸附柱CR放回收集管中,确保盖好吸附柱管盖。
9. 关键步骤:彻底去除吸附柱上的残余乙醇:
13,000 rpm将吸附柱CR空甩离心2 分钟,去除吸附柱上的残余液体。
注:此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验操作。
10. 洗脱得到RNA:
将RNA吸附柱CR转入一个新的1.5 ml RNase-free离心管中,向吸附柱O型垫圈中央悬空加入50-100 μl RNase-free水(事先65℃预热可提高洗脱效率),盖好吸附柱管盖,常温放置2分钟,13,000
rpm离心2 分钟。
注:确保水要加到膜的中央,不要贴壁加入;洗脱缓冲液体积不应少于50 μl,体积过小影响回收效率。
11. RNA贮存:
RNA样品-80℃中保存。
● RNA产量和质量的评估:
1. RNA产量:
用分光光度计测定OD260的吸光值来计算RNA产量。将RNA按照一定的比例稀释于TE溶液(10mMTris pH8.0,1mMEDTA)中,根据以下公式计算:
A260×稀释倍数×40=μg
RNA/ml
注:测定OD值时,尽量不要用RNase-free水稀释RNA,因为RNase-free水pH较低,测定的OD值偏低。
2. RNA质量:
凝胶电泳检测:凝胶电泳中,完整的RNA应该有两条主带:28S和18S,并且28S亮度应该与18S相当或是其亮度的2倍。可以使用普通的1×TAE琼脂糖凝胶电泳,凝胶浓度1-1.5
%,可以使用高电压,短时间电泳,如7V/cm电泳,20分钟。建议使用D2000
DNA ladder(Cat:RTM415)作为Marker。植物28S rRNA迁移率与1500bp类似,18S rRNA迁移率与1000bp类似。
吸光值检测:可以用A230,A260和A280的数值表示RNA的纯度。纯净的RNA的 A260/A280比值应该为2,我们得到的RNA样品比值应在1.8-2.2之间,如果比值低于1.8,表明RNA样品中蛋白污染比较严重。A260/A230比值应该在2-2.2之间。如果此比值低于2,表明RNA样品中有胍盐,多糖的污染。